Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1eQ8K202 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms