Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700001C19RikQ8K168 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700001C19RikQ8K168 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700001C19RikQ8K168 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms