Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt33aQ8K0Y2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt33aQ8K0Y2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms