Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem17Q8K0U3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms