Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR4

Slc1a7, Excitatory amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a7Q8JZR4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a7Q8JZR4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc1a7Q8JZR4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms