Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms