Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip3Q8CHD8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip3Q8CHD8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
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