Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr2bQ8CFI7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Polr2bQ8CFI7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Polr2bQ8CFI7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Polr2bQ8CFI7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Polr2bQ8CFI7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Polr2bQ8CFI7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Polr2bQ8CFI7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Polr2bQ8CFI7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr2bQ8CFI7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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