Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Hpf1Q8CFE2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Hpf1Q8CFE2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Hpf1Q8CFE2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hpf1Q8CFE2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms