Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28bQ8CEG5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms