Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc178Q8CDV0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc178Q8CDV0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms