Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rsph4aQ8BYM7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph4aQ8BYM7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms