Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms