Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sall4Q8BX22 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sall4Q8BX22 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms