Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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