Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms