Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt12Q8BG71 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms