Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sv2bQ8BG39 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms