Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2bQ80ZJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cracr2bQ80ZJ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms