Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

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Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
NischQ80TM9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
NischQ80TM9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
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