Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna12Q80SS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms