Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV1

Fam57b, Protein FAM57B, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam57bQ7TNV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam57bQ7TNV1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam57bQ7TNV1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms