Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx4Q7TNK1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx4Q7TNK1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms