Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms