Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TwistnbQ78WZ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms