Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd3eapQ76KJ5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eapQ76KJ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms