Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SynmQ70IV5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SynmQ70IV5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SynmQ70IV5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms