Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv1Q704Y3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv1Q704Y3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms