Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfflQ6ZQM0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfflQ6ZQM0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms