Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup188Q6ZQH8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms