Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nemp1Q6ZQE4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms