Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b3Q6UQ17 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms