Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bms1Q6PGF5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms