Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SvoplQ6PDF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SvoplQ6PDF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms