Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak1Q6PD31 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak1Q6PD31 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms