Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frg2f1Q6P3A2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frg2f1Q6P3A2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms