Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Soga3Q6NZL0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Soga3Q6NZL0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms