Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Szrd1Q6NXN1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms