Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpbp1Q6NXH3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms