Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms