Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms