Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo27Q6DIA9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms