Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop58Q6DFW4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Nop58Q6DFW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop58Q6DFW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms