Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pram1Q6BCL1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pram1Q6BCL1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms