Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ltn1Q6A009 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltn1Q6A009 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltn1Q6A009 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms