Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk13Q69ZA1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk13Q69ZA1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms