Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn4Q69Z26 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn4Q69Z26 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms