Protein–RNA interactions for Protein: Q66JS6

Eif3j2, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j2Q66JS6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3j2Q66JS6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3j2Q66JS6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms