Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ScxQ64124 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScxQ64124 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScxQ64124 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ScxQ64124 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms