Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms